菌種鑒定需提取基因組DNA,利用PCR擴增特定rDNA片段,在GeneBank上進行序列比對,一般序列相似度在97%以上就可以認為是同種菌。箭速基因擁有微生物菌種分類鑒定的分子生物學實驗室,配有PCR儀、高速冷凍離心機、電泳儀、HPLC、凝膠成像系統、紫外控溫分析系統等先進儀器設備,采用序列分析法,方便、快捷地完成各種細菌的分子生物學鑒定幫助您獲得真實、可信的結果。
樣本類型
1.樣品形式要求:帶有單一菌種的單菌落培養平板或斜面(比例占試管1/2以上,但不要超過3/4)、無明顯降解的基因組DNA(濃度不低于10 ng/μl,總體積至少大于20μl)。
2.對于細胞壁較厚的革蘭氏陽性細菌,常規方法難以破壞細胞壁,建議您提供基因組DNA(用乙醇沉淀法去除PCR抑制物)。
3.厭氧菌、放線菌等特別菌株請在服務開展前與技術支持進行溝通。
4.為保證實驗順利進行,建議樣本低溫運輸。
一、細菌菌種鑒定
細菌的rRNA有5S、16S和23S三種。其中16S rRNA分子量約1500bp,所代表的細菌信息量適中,適合進行分類研究。
服務內容
1、細菌16S rDNA部分序列解析
擴增細菌16S rRNA的全長序列,只使用Seq forward進行一個測序反應(有效序列500~600 bp),即可得到含有部分種屬特異性的16S信息,是一種較為經濟便捷的鑒定方法。
2、細菌16S rDNA全序列解析
擴增細菌16S rRNA的全長序列,長度約1400 bp~1500 bp,進行三個測序反應,測得全長序列,即較為全面的種屬特異性信息。
價格及周期
交付內容
1、PDF版實驗報告
2、測序彩色波形圖
3、序列堿基圖
4、NCBI比對結果
二、真菌26S rDNA D1/D2區序列解析
真菌基因組中編碼核糖體RNA的基因有四種:26S rDNA、5S rDNA、18S rDNA和5.8S rDNA.真菌大亞基上的26S rDNA 可分為D1、D2…D12等多個區域,其中D1/D2區域序列長度適中,適合于真菌鑒定。
服務內容
1、真菌26S rDNA D1/D2區序列解析。
擴增真菌26S rDNA D1/D2區片段,長度約500~600 bp,只需進行一個測序反應,即可得到26S rDNA D1/D2區序列信息。該方法特別適合酵母菌的鑒定。
2、真菌ITS全列序列解析。
PCR擴增真菌ITS區片段,長度約300~1,000 bp,依據PCR擴增片段的長度,進行一個至兩個測序反應,即可得到ITS區全序列信息。對于一些真菌,26S rDNA D1/D2區或ITS區結構復雜,進行一個方向的測序可能不能得到全序列,這時需同時進行反方向的序列測定。
價格及周期
交付內容:
1、PDF版實驗報告
2、測序彩色波形圖
3、序列堿基圖
4、NCBI比對結果
訂購流程
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